В данной статье рассмотрена трансформация технологической и научно-методической работы ГПНТБ СО РАН в результате реформирования трех российских академий наук (РАН, РАМН и РАСХН). В новых условиях функционирования информационно-библиотечной системы требуется определение механизмов взаимодействия и взаимоотношений библиотечных структур.