научная статья

КОНСЕНСУС САЙТА СВЯЗЫВАНИЯ ТРАНСКРИПЦИОННОГО ФАКТОРА SF-1 И ЕГО ПОТЕНЦИАЛЬНЫЕ САЙТЫ В 5'-ФЛАНКИРУЮЩИХ РАЙОНАХ ГЕНОВ ФЕРМЕНТОВ СТЕРОИДОГЕНЕЗА 3βHSDI И Cyp17 МЫШИ

Бусыгина Т.В.
Институт цитологии и генетики СО РАН
Игнатьева Е.В.
Институт цитологии и генетики СО РАН
Осадчук А.В.
Институт цитологии и генетики СО РАН
Биохимия
№ 4 / 2003
страницы: 467-476
На основе выборки, включающей 42 нуклеотидные последовательности сайта связывания транскрипционного фактора SF-1, построен десятибуквенный консенсус сайта связывания этого фактора - GTCAAGGTCA. В частотной матрице консенсуса наибольшие частоты имеют нуклеотиды, занимающие с 3-й по 7-ю позиции, причем гуаниновые нуклеотиды в 6-м и 7-м положениях обнаружены во всех нуклеотидных последовательностях, что указывает на их важную роль при взаимодействии ДНК с белком SF-1. С использованием полученного консенсуса проведен поиск потенциальных сайтов связывания данного фактора в регуляторных районах генов двух микросомальных ферментов стероидогенеза у мышей. В 5'-фланкирующих областях генов Cyp17 (17 α-гидроксилазы/17-20-лиазы) и 3βHSDI (3β-гидроксистероиддегидрогеназы/4Δ-5Δ-изомеразы I) найдены соответственно шесть и пять таких сайтов. Наличие потенциальных сайтов связывания фактора SF-1 в регуляторных районах генов Cyp17 и 3βHSDI мыши позволяет рассматривать ген SF-1 как один из генов-кандидатов, которые, как ранее было предсказано авторами, определяют координированную наследственную изменчивость гормональной активности клеток Лейдига у мышей.